目前，市場上主要肥料有三種，化學肥料、有機肥料、復合肥料。生物有機肥是相對化學肥料、有機肥料而言的。同時生物有機肥是一種新型的肥料，較前三種肥料有明顯的優勢。
化肥 | 有機肥 | 復合肥 | 生物有機肥 | |
優 點 | 1 濃度高、肥效快速，分解和吸收迅速； 2 短期效果明顯，能促進植物生長、開花、結果； 3 水溶性好、利用率高； 4 單一養分充足； 5 農民使用多年，優點顯著。
| 1 使用成本低。 2 肥效長。 3 養分全面，能促進植物生長、開花、結果 4 改善土壤結構，解決土壤板結問題 5 少量有益微生物，能調節生態環境 6 能和其它化肥一起使用。
| 成分為化肥和有機肥的復合。 1綜合化肥和有機肥的特點。 2 肥效較慢，含有一定的有機質， 3補充特定的微量元素。 4 能改善土壤結構，緩解土壤板結。 5 少量有益微生物，能調節生態環境。 6不含有毒有害物質。 | 1使用成本低，肥效長，肥效穩定釋放。 2 營養全面，能促進植物生長、開花、結果。 3改良土壤結構，解決土壤板結問題，恢復土壤自我生產能力。 4肥料成熟度高，不會造成燒苗不含重金屬、蟲卵、病菌等有害物質 5 能預防病蟲害發生，減少土壤殘留的害蟲卵和病原菌，減少連作障礙。 6減少農藥的使用，降解植物和土壤中農藥殘留。 7 含有大量有益微生物，能夠分泌生物活性物質，改善生態環境，防止河流、湖泊富營養化。 8提高農產品品質、口感、營養，能達到綠色、無公害種植標準。 |
缺點 | 1 成本高，有機質含量低，養分單一，養分不穩定，流失快。 2 易造成土壤板結，損害土壤微生物生長的環境，使用效果逐漸下降。 3 病蟲害連年加重，易造成環境污染 4降低農作物的品質，口感和營養降低 5 市場競爭激烈。 | 1 養分含量相對較低，肥效慢，有時穩定性差。 2 發酵不徹底，肥料成熟度低，易造成燒苗。 3重金屬等有毒有害物質含量高。 4易傳播土傳病蟲害。 5肥料中臭味導致施用不方便 | 1 部分產品制作工藝簡單，使用效果差。 2易傳播土傳病蟲害，病蟲害連年加重等情況。 3假冒偽劣產品多，農民不易辨別
| 1肥效較化肥稍慢，短期內還需施用一定化肥。 2 推廣時，由于中國農產品認證法規執行不嚴，部分地區農產品還做不到高質高價等原因，影響農民的使用積極性。 |
肥料市場由以前的單一成分的肥料轉變為現在的復合性肥料。目前市場的復合性肥料主要有有機-無機復合肥、生物有機復合肥。而我們的生物有機肥可以在原有機-無機復合肥基礎上有針對性的加入微生物制劑而成。它是在彌補以前肥料的不足，更突出優質的新型復合肥料，并且符合有機、綠色農業生產需要。此項技術在國內外屬于新技術，目前同類產品較少，優質產品更少；而我們的產品性價比高，競爭力強。在提倡食品營養、安全的大環境下，生物有機肥中國具有巨大的市場。同時國外市場由于原料供應不暢，無法滿足市場需求，因此國際市場也存在著相當大的市場缺口?？傊?，生物有機肥其應用前景廣泛，市場潛力巨大。
制造工藝的比較
化肥：目前大多數化肥廠的制作工藝相差不大，因此制造成本幾乎相同。但是都存在先進設備昂貴，占地面積大，耗能大，污染嚴重。制造出的肥料臭味重。
有機肥：一般是用發酵法和高溫消毒法來制作的。高溫消毒法會破壞蛋白質和維生素等營養物質，其產品的營養較低。因此需要加入化學肥料來復合。這樣達不到國家綠色肥料的標準，而且成本加大。發酵法主要是利用酵母菌在常溫下，分解雞糞和秸桿中纖維素，其發酵菌種單一。工藝低的肥料成熟度不高；有害物質如重金屬、殘留病源菌和害蟲卵仍然存在。
生物有機肥；其主要工藝也是發酵法，區別是由于菌種的多樣化、菌群的穩定存在，肥料可以解決成熟度問題、重金屬和殘留病源菌和害蟲卵問題。另一方面，發酵是在常溫下進行的，工廠車間污染極少，肥料只經過發酵手段即可達到國家綠色肥料的標準。廠區也可以作為綠色工廠的示范。
